计算机科学与技术名家讲座系列报道
2014年6月30日,美国密苏里大学哥伦比亚分校计算机系主任,西汉姆联必威登录唐敖庆讲座教授,博士生导师,许东教授为公司师生做了题为《Computational Studies of Genotype – Phenotype Relationships》的学术报告。
许东教授是生物信息学和计算机科学专家,从事基因组及蛋白质等领域研究多年,取得了丰硕的成果。此次学术报告的主要围绕生物信息学中最重要的问题之一“基因对植物性状表现的影响”展开讨论。许东教授首先提出概念:最新研究发现,植物的性状不是由单一的SNP所决定的,有证据表明多个SNP间的共同作用对性状的影响更为强烈。同时,单一SNP的相关研究,比如在育种方面已经遇到了瓶颈,因此研究多位点组合对植物性状的影响是未来的发展方向。在此基础上,许东教授结合其项目组的具体研究成果,在技术层面简要的为大家介绍了相关的算法:Bayesian Partition和Lasso等,并鼓励大家在科研中合理使用相关的经典算法。之后,许东教授提出该项研究的前景和应用:把该技术整合到大豆分析平台中,指导有针对性的大豆杂交,大量减少真正用于杂交实验的植株数,节约成本。并且在未来建立一套完整的分析工具箱,更好的支持农业的发展。
在报告的最后,许东教授与在场的师生进行了热烈的讨论,大家不仅对算法提出了自己的见解,更是对此技术的应用前景产生了强烈的反响,甚至比较了我国东北大豆主产区和美国环境及技术的差异等。